Results of multiplex polymerase chain reaction assay to ıdentify urethritis pathogens

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorSarıer, Mehmet
dc.contributor.authorDuman, İbrahim
dc.contributor.authorGöktaş, Şafak
dc.contributor.authorDemir, Meltem
dc.contributor.authorKukul, Erdal
dc.date.accessioned2021-05-15T12:56:30Z
dc.date.available2021-05-15T12:56:30Z
dc.date.issued2017
dc.departmentFaculty of Medicine, Department of Urologyen_US
dc.departmentFaculty of Medicine, Department of Biochemistry
dc.description.abstractObjective: The purpose of this study was to evaluate the results of multiplex polymerase chain reaction (PCR) test applied to identify the pathogens in male patients who attended our urology clinic with a pre-diagnosis of urethritis related with sexual intercourse.Materials and Methods: In this study, we included a total of 91 male patients, who sought medical advice in our clinic between August 2015 and October 2016 due to complaints of urethral discharge, dysuria and urethral itching, having a visible urethral discharge during the physical examination or a positive leukocyte esterase test (Combur-Test®-Roche) in the first urine sample. In the urethral swab samples of these patients, urethritis pathogens were searched with a multiplex PCR test. The multiplex PCR kit, which is able to identify nine pathogens and produced by PathoFinder® (Holland), was used in the process. The pathogens that could be detected by the kit were Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Gardnerella vaginalis, Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum, and Candida albicans.Results: The average age of the subjects was 35.1 years. Sixty one out of 91 patients (67%) were found to have a pathogen in the urethral swab sample. In 45 patients (49.4%), only one pathogen, in 12 (13.1%) - two different pathogens and in 4 (4.3%) patients, 3 different pathogens were detected. The pathogens found were as follows: Ureaplasma urealyticum in 22 patients (27.1%), Gardnerella vaginalis in 15 (18.6%), Neisseria gonorrhoeae in 13 (16.1%), Mycoplasma genitalium (10 patients; 12.3%), Mycoplasma hominis (8 patients; 9.9%), Chlamydia trachomatis (8 patients; 9.9%), Trichomonas vaginalis (3 patients; 3.8%), and Candida albicans (2 patients; 2.4%). None of the patients were identified with Treponema pallidum. None of the pathogens were identified in 30 patients (32.9%) whose samples were examined by PCR method.Conclusion: Sexually transmitted pathogens that are quite difficult to identify and that cause urethritis are possibly defined with only one swab sample in a short time using multiplex PCR method providing new possibilities and scopes for the diagnosis.en_US
dc.description.abstractAmaç: Bu çalışmanın amacı; cinsel ilişkiye bağlı üretrit ön tanısı ile kliniğimize başvuran erkek hastalarda, patojenin tespiti için uygulanan multipleks polimeraz zincir reaksiyon (PCR) testinin sonuçlarının değerlendirilmesidir.Gereç ve Yöntem: Kliniğimize Ağustos 2015-Ekim 2016 tarihleri arasında cinsel ilişki sonrası üretral akıntı, disüri, üretral kaşıntı şikayetleri ile başvuran, fizik muayenesinde görünür üretral akıntısı olan veya ilk idrar örneğinde lökosit esteraz testi (Combur-Test®-Roche) pozitif olan 91 erkek hasta çalışmaya dahil edildi. Bu hastaların üretral swap örneğinde multipleks PCR testi ile üretrit patojenleri araştırıldı. Bu amaçla PathoFinder® (Hollanda) firmasının 9 patojeni tespit eden multipleks PCR kiti kullanıldı. Kitin saptadığı etkenler; Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma hominis, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum, Gardnerella vaginalis, Trichomonas vaginalis, Treponema pallidum ve Candida albicans'tı.Bulgular: İnceleme yapılan 91 hastanın ortalama yaşı 35,1 idi . Doksan bir hastanın 61'inde (%67) üretral sürüntü örneğinde patojen saptandı. Bunlardan 45 (%49,4) hastada tek patojen, 12'sinde (%13,1) 2 farklı patojen ve 4'ünde (%4,3) ise 3 farklı patojen saptandı. Hastalarda saptanan patojenler sırasıyla, 22'si (%27,1) Ureaplasma urealyticum, 15'i (%18,6) Gardnerella vaginalis, 13'ü (%16,1) Neisseria gonorrhoeae, 10'u (%12,3) Mycoplasma genitalium, 8'i (%9,9) Mycoplasma hominis, 8'i (%9,9) Chlamydia trachomatis, 2'si (%2,4) Candida albicans ve 3'ü (%3,8) de Trichomonas vaginalis'ti. Hastaların hiçbirinde Treponema pallidum tespit edilmedi. Örnek alınan hastaların 30'unda (%32,9) PCR yöntemi ile hiçbir patojen saptanmadı. Sonuç: Multipleks PCR yöntemi ile, saptanması oldukça zor olan cinsel yolla geçen ve üretrit nedeni patojenlerin tek bir üretral sürüntü örneğiyle, kısa sürede saptanır hale gelmesi, tanıya yeni olanaklar ve fırsatlar sağladığı görülmektedir.en_US
dc.identifier.citationSarıer, M., Duman, B., Göktaş, A., Demir, M., Kukul, E. (2017). Results of Multiplex Polymerase Chain Reaction Assay to Identify Urethritis Pathogens. Journal of Urological Surgery, 4(1), 18–22. https://doi.org/10.4274/jus.1328
dc.identifier.doi10.4274/jus.1328
dc.identifier.endpage22en_US
dc.identifier.issn2148-9580
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage18en_US
dc.identifier.trdizinid257092
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TWpVM01Ea3lNZz09
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12939/1477
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.4274/jus.1328
dc.identifier.volume4en_US
dc.identifier.wosWOS:000400679400004
dc.identifier.wosqualityN/A
dc.indekslendigikaynakWeb of Science
dc.indekslendigikaynakTR-Dizin
dc.institutionauthorSarıer, Mehmet
dc.institutionauthorDemir, Meltem
dc.institutionauthorDuman, İbrahim
dc.language.isotr
dc.relation.ispartofJournal of Urological Surgery
dc.relation.publicationcategoryMakale - Uluslararası Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/closedAccessen_US
dc.subjectPolymerase Chain Reactionen_US
dc.subjectUrethritisen_US
dc.subjectMycoplasmaen_US
dc.subjectUreaplasma
dc.subjectGardnerella Vaginalis
dc.subjectSexual Transmitted Disease
dc.titleResults of multiplex polymerase chain reaction assay to ıdentify urethritis pathogens
dc.title.alternativeÜretrit patojenlerinin saptanmasında multipleks polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi
dc.typeArticle

Dosyalar

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu
Temel Tıp Bilimleri Bölümü Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu